pseudobulkdeg
Performs pseudo-bulk differential gene expression analysis using DESeq2 or edgeR. Aggregates single-cell counts to sample-level pseudo-bulk data, then identifies differentially expressed genes between conditions while accounting for biological replicates. Supports complex experimental designs including batch effects, paired samples, and interaction terms.
Installation
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Fonctions et usage
Performs pseudo-bulk differential gene expression analysis using DESeq2 or edgeR. Aggregates single-cell counts to sample-level pseudo-bulk data, then identifies differentially expressed genes between conditions while accounting for biological replicates. Supports complex experimental designs including batch effects, paired samples, and interaction terms.
Démarrage rapide
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Guides ↗Exemples
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- Date d’indexation
- 2026-01-21
- Mise à jour de l’index
- 2026-01-23
- Branch
- main
Les dates concernent ce répertoire. Consultez le dépôt pour l’historique du code.
GitHub ↗chat Comments (0)
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