bio-workflows-microbiome-pipeline
End-to-end 16S amplicon workflow from FASTQ reads to differential abundance. Orchestrates DADA2 ASV inference, taxonomy assignment, diversity analysis, and compositional testing with ALDEx2.
Installation
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Fonctions et usage
End-to-end 16S amplicon workflow from FASTQ reads to differential abundance. Orchestrates DADA2 ASV inference, taxonomy assignment, diversity analysis, and compositional testing with ALDEx2.
Démarrage rapide
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Guides ↗Exemples
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- Date d’indexation
- 2026-01-22
- Mise à jour de l’index
- 2026-03-04
- Branch
- main
Les dates concernent ce répertoire. Consultez le dépôt pour l’historique du code.
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