bio-read-qc-quality-filtering
Filter reads by quality scores, length, and N content using Trimmomatic and fastp. Apply sliding window trimming, remove low-quality bases from read ends, and discard reads below thresholds. Use when reads have poor quality tails or require minimum quality for downstream analysis.
Installation
Suivez les instructions du dépôt pour votre agent. Consultez les fichiers et dépendances avant l’installation.
Voir la source ↗GuidesInstructions
Fonctions et usage
Filter reads by quality scores, length, and N content using Trimmomatic and fastp. Apply sliding window trimming, remove low-quality bases from read ends, and discard reads below thresholds. Use when reads have poor quality tails or require minimum quality for downstream analysis.
Démarrage rapide
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Guides ↗Exemples
Consultez les exemples du dépôt source.
Voir la source ↗Historique source
- Date d’indexation
- 2026-01-22
- Mise à jour de l’index
- 2026-03-04
- Branch
- main
Les dates concernent ce répertoire. Consultez le dépôt pour l’historique du code.
GitHub ↗chat Comments (0)
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