bio-microbiome-qiime2-workflow
QIIME2 command-line workflow for 16S/ITS amplicon analysis. Alternative to DADA2/phyloseq R workflow with built-in provenance tracking. Use when preferring CLI over R, needing reproducible provenance, or working within QIIME2 ecosystem.
Installation
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Fonctions et usage
QIIME2 command-line workflow for 16S/ITS amplicon analysis. Alternative to DADA2/phyloseq R workflow with built-in provenance tracking. Use when preferring CLI over R, needing reproducible provenance, or working within QIIME2 ecosystem.
Démarrage rapide
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Guides ↗Exemples
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- Date d’indexation
- 2026-01-22
- Mise à jour de l’index
- 2026-03-03
- Branch
- main
Les dates concernent ce répertoire. Consultez le dépôt pour l’historique du code.
GitHub ↗chat Comments (0)
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