track-generation
This skill generates normalized BigWig (.bw) tracks (and/or fold-change tracks) from BAM files for ATAC-seq and ChIP-seq visualization. It handles normalization (RPM or fold-change) and Tn5 offset correction automatically. What's more, this skill can help user visualize the signal profiles around TSS or target regions. Use this skill when you have filtered and generated the clean BAM file (e.g. `*.filtered.bam`).
Installation
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Fonctions et usage
This skill generates normalized BigWig (.bw) tracks (and/or fold-change tracks) from BAM files for ATAC-seq and ChIP-seq visualization. It handles normalization (RPM or fold-change) and Tn5 offset correction automatically. What's more, this skill can help user visualize the signal profiles around TSS or target regions. Use this skill when you have filtered and generated the clean BAM file (e.g. `*.filtered.bam`).
Démarrage rapide
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Guides ↗Exemples
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- Date d’indexation
- 2026-01-20
- Mise à jour de l’index
- 2026-01-26
- Branch
- main
Les dates concernent ce répertoire. Consultez le dépôt pour l’historique du code.
GitHub ↗chat Comments (0)
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