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chipseq-qc

Performs ChIP-specific biological validation. It calculates metrics unique to protein-binding assays, such as Cross-correlation (NSC/RSC) and FRiP. Use this when you have filtered the BAM file and called peaks for ChIP-seq data. Do NOT use this skill for ATAC-seq data or general alignment statistics.

BIsnake2001☆ 3 Étoiles du dépôt2 Forks du dépôt

Installation

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Instructions

Fonctions et usage

Performs ChIP-specific biological validation. It calculates metrics unique to protein-binding assays, such as Cross-correlation (NSC/RSC) and FRiP. Use this when you have filtered the BAM file and called peaks for ChIP-seq data. Do NOT use this skill for ATAC-seq data or general alignment statistics.

Démarrage rapide

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Exemples

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Historique source

Date d’indexation
2026-01-20
Mise à jour de l’index
2026-01-26
Branch
main

Les dates concernent ce répertoire. Consultez le dépôt pour l’historique du code.

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